전략기획실에 전략홍보과를 신설하고, 전략기획실의 6시그마팀을 기술개발단으로, 수송안전실 고속운전팀은 고속철도사업본부로 이관한다. 또한 교육훈련을 인력개발로, 경영혁신을 업무혁신 등으로 혁신기획과 일부팀 명칭을 변경한다.
본부 및 소속기관의 일부 분장사무도 조정되는데, 시설사용료 산정업무를 철도시설건설단에서 전략기획과로 이관하고, 각 사업부의 수송원가산정업무를 재무관리과에서 총괄한다.
그 외에도 열차운영과 동력차팀, 전기과 전기사령팀을 각 지역본부에 신설한다. 현업직원의 직명 중 선임여객전무는 열차팀장으로 바꿔 부르도록 했다.
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